中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所创建于1963年5月，是我国唯一从事渔业装备与工程及相关学科的应用基础研究和关键技术研发的研究机构。2005年至今连续八届获得上海市文明单位荣誉称号。

    研究所创建于1958年10月，历经中国科学院上海水产研究所、上海市水产研究所、水产部东海水产研究所、上海市海洋渔业公司东海水产研究所、国家水产总局东海水产研究所等发展时期，1982年10月统一划归中国水产科学研究院管理。2003年进入国家科技创新体系（国家非营利性科研机构）；2005年通过中国质量认证中心ISO9001质量管理体系认证，成为我国渔业科研系统第一个进入ISO9001质量管理体系的单位。

    研究所承担我国渔业发展中的全局性、基础性、关键性和方向性的重大科技任务，为我国渔业科技进步、行业管理和产业发展提供服务。主要开展远洋与极地渔业资源开发、河口与近海渔业生态学、渔业资源保护及利用、捕捞与渔业工程、渔业生态环境评价与保护、水产养殖技术、水产遗传育种与生物技术、水产品加工与质量安全、渔业信息与战略等研究。经农业农村部批准的中国水产科学研究院发展规划中确定将我所建成国家级远洋和河口渔业研究中心。